При передаче товаров комиссионеру предприятие должно выписать налоговую накладную на стоимость таких товаров

Ваш клиент прав. В соответствии с определением (пп. 14.1.191 Налогового кодекса) поставка товаров подразумевает любую передачу права распоряжения товарами как собственник, в том числе продажу, обмен, дарение такого товара. Поставкой товара в целях налогообложения также считается передача товаров согласно с договором, по которому уплачивается комиссия (вознаграждение) за продажу или покупку, то есть по договору комиссии.

Относительно передачи товара на комиссию раздел 5 Налогового кодекса Украины содержит специальную норму. Согласно п. 189.4. НК, базой налогообложения для товаров/услуг, которые передаются/получаются в рамках договоров комиссии (консигнации), поручительства, доверительного управления, является стоимость поставки этих товаров, определенная в соответствии со ст. 188 НК. Датой увеличения налоговых обязательств и налогового кредита налогоплательщиков, которые осуществляют поставку/получение товаров/услуг в рамках договоров комиссии (консигнации), поручительства, поручения, доверительного управления, прочих гражданско-правовых договоров и без права собственности на такие товары/услуги, определяется по правилам, установленным статьями 187 и 198 Налогового кодекса.

Статья 188 НК определяет, что база налогообложения НДС операций по поставке товаров определяется исходя из договорной стоимости, но не ниже уровня обычных цен на такие товары. Датой возникновения налоговых обязательств при поставке товаров/работ/услуг считается дата, которая припадает на налоговый период, в течение которого происходит любое из событий, произошедшее ранее: дата зачисления средств от покупателя или дата отгрузки товаров (п. 187.1. НК).

Поэтому Ваше предприятие действительно должно выписать налоговую накладную на стоимость таких товаров комиссионеру по дате события, произошедшего ранее. В Вашем случае — это передача товаров комиссионеру.